Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLD1P28340 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLD1P28340 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLD1P28340 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLD1P28340 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLD1P28340 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLD1P28340 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms