Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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PTPRBP23467 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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PTPRBP23467 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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