Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms