Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRB1P04280 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRB1P04280 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRB1P04280 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRB1P04280 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PRB1P04280 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRB1P04280 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRB1P04280 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRB1P04280 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRB1P04280 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRB1P04280 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRB1P04280 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRB1P04280 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRB1P04280 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRB1P04280 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRB1P04280 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRB1P04280 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRB1P04280 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRB1P04280 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PRB1P04280 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRB1P04280 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms