Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPAG9O60271 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG9O60271 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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