Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms