Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F3O00716 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms