Protein–RNA interactions for Protein: O00574

CXCR6, C-X-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6O00574 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCR6O00574 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms