Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNFSF18Q9UNG2 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms