Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNKQ9P0W0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms