Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms