Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms