Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 FAM131A-211ENST00000639617 4450 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 RBMXL3-201ENST00000424776 3442 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 AL359641.1-201ENST00000412509 1558 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 IRF5-213ENST00000489702 2988 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 MAP3K9-204ENST00000554146 2982 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 PDE9A-207ENST00000398224 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 PDE9A-210ENST00000398229 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 EGFLAM-202ENST00000336740 3071 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 KIF26B-201ENST00000366518 12113 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 GTPBP2-201ENST00000307114 2830 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 BTD-201ENST00000303498 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 MYCNOS-202ENST00000641263 1313 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 AKAP10-201ENST00000225737 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 TTLL13P-206ENST00000641754 2256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 PCDHB11-201ENST00000354757 4198 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PRAC1Q96KF2 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 MAMDC2-201ENST00000377182 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 BTN3A2-202ENST00000377708 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 SFI1-203ENST00000400288 4002 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 KIAA1755-201ENST00000279024 6429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 TWNK-202ENST00000370228 3175 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 AC007608.4-201ENST00000623140 3365 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 VPS39-201ENST00000318006 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 AJ239328.1-201ENST00000626237 4807 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 CRYZ-205ENST00000417775 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 MASP1-201ENST00000169293 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 DDI1-201ENST00000302259 2609 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 TBCEL-202ENST00000422003 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 CDH11-212ENST00000566827 2395 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 WARS-202ENST00000355338 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ENPP2-203ENST00000427067 3271 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 MROH1-211ENST00000544576 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 BACH2-210ENST00000537989 9108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 SLC9A8-202ENST00000417961 6309 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 EGFR-211ENST00000638463 4735 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 LRP5L-208ENST00000610821 3602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ATXN7L3-202ENST00000454077 3523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms