Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms