Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms