Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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