Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDXQ7Z353 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms