Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAD11Q709F0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms