Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms