Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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