Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM16LQ309B1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM16LQ309B1 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms