Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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