Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SEC23BQ15437 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms