Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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