Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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ITGA9Q13797 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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ITGA9Q13797 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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