Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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APOFQ13790 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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APOFQ13790 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
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APOFQ13790 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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APOFQ13790 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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APOFQ13790 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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APOFQ13790 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
APOFQ13790 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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