Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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