Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FOXE3Q13461 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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FOXE3Q13461 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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FOXE3Q13461 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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FOXE3Q13461 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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FOXE3Q13461 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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