Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KIF5AQ12840 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms