Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms