Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms