Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms