Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms