Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms