Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms