Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MDH1P40925 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms