Protein–RNA interactions for Protein: P40123

CAP2, Adenylyl cyclase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP2P40123 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAP2P40123 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP2P40123 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP2P40123 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms