Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTSSP25774 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTSSP25774 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTSSP25774 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTSSP25774 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTSSP25774 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTSSP25774 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CTSSP25774 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTSSP25774 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTSSP25774 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTSSP25774 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTSSP25774 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTSSP25774 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTSSP25774 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTSSP25774 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTSSP25774 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTSSP25774 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTSSP25774 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTSSP25774 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTSSP25774 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTSSP25774 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTSSP25774 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CTSSP25774 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTSSP25774 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTSSP25774 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTSSP25774 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CTSSP25774 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTSSP25774 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CTSSP25774 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CTSSP25774 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTSSP25774 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTSSP25774 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTSSP25774 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTSSP25774 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTSSP25774 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
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CTSSP25774 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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CTSSP25774 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CTSSP25774 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTSSP25774 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CTSSP25774 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTSSP25774 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTSSP25774 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTSSP25774 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTSSP25774 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CTSSP25774 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CTSSP25774 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTSSP25774 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CTSSP25774 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CTSSP25774 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTSSP25774 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTSSP25774 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CTSSP25774 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTSSP25774 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTSSP25774 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTSSP25774 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTSSP25774 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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