Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC175P0C221 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms