Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTCP00480 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTCP00480 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTCP00480 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTCP00480 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTCP00480 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTCP00480 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTCP00480 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTCP00480 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTCP00480 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTCP00480 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTCP00480 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTCP00480 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTCP00480 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms