Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms