Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MSI1O43347 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MSI1O43347 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSI1O43347 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSI1O43347 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSI1O43347 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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MSI1O43347 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSI1O43347 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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MSI1O43347 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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MSI1O43347 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSI1O43347 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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MSI1O43347 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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MSI1O43347 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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MSI1O43347 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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MSI1O43347 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSI1O43347 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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MSI1O43347 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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MSI1O43347 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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MSI1O43347 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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MSI1O43347 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms