Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms