Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms