Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms