Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW19

KIFC1, Kinesin-like protein KIFC1, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC1Q9BW19 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KIFC1Q9BW19 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KIFC1Q9BW19 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIFC1Q9BW19 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIFC1Q9BW19 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIFC1Q9BW19 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIFC1Q9BW19 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIFC1Q9BW19 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIFC1Q9BW19 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIFC1Q9BW19 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIFC1Q9BW19 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIFC1Q9BW19 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIFC1Q9BW19 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIFC1Q9BW19 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIFC1Q9BW19 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KIFC1Q9BW19 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIFC1Q9BW19 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KIFC1Q9BW19 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIFC1Q9BW19 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KIFC1Q9BW19 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms