Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms