Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms