Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms