Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF34Q969K3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms